苏州农业职业技术学院生态环境系创建于2002年，其前身是苏州府农业学堂农业科实习学科，已有99年的历史，曾为国家培养了许多农业科技界的先驱、农业科技专家以及农业科技精英。
本系设有作物生产、机械、机电控制三个教研室，设有作物生产技术、机电一体化技术(三个方向)、汽车电子技术共三个专业，共有在校生994人。培养了大批从事现代农艺生产和推广，机电类专业技术等高等技术心刖型人才。现有专兼职教师47名，其中教授1名，副教授8名，高级农艺师4名，工程师、讲师20名，有10名教师先后赴日本、德国、法国、美国、韩国等地研修考察，形成一支教学水平高，实践技能强的教师队伍，是学院的主要系部。
本系一贯坚持教育为社会服务，为学生服务的新理念，根据苏州以及江苏地域发展的新特点、新情况，对现有的专业适时的进行调整、延伸和扩展，为社会培养具有较强实践技能、职业能力的应用型高级人才。围绕“底厚、面宽、知识新、技能强”的培养目标，坚持教学、科研、生产相结合，积极进行专业课程的调整，教学内容及教学模式的探索。激发学生学习的兴趣，注重实践技能的培养，提高跨工种、跨职业的能力，注重培养学生有效的人际沟通能力。
园艺与园林系
苏州农业职业技术学院园艺与园林系于2002年建立，其前身是江苏省苏州农业学校园艺学科，开设园艺专业始于1912年，是中国开设该专业最早的学校之一，曾为国家培养了数以千计的园艺专业人才和以一代宗师章守玉为代表的几代园艺学家，为园艺教学、科研与生产作出过历史性的贡献。
本系设有园艺、风景园林、生态环保三个专业教研室，已开设园艺技术、园林技术、环境监测与治理技术等专业。本系现有专兼职专业教师82人，包括教授3人，研究员1人，副教授13人，高级农艺师12人\高级工程师（建筑师）8人、讲师（农艺师）22人，助讲21人（其中，博士5人，硕士18人，在职研究生15人）。有全国模范教师2人，省委“333人才工程第三层次培养对象”2人，学院名师8人，教坛新秀6人。有20多名教师曾被派往日本、德国、法国、荷兰、美国、俄罗斯、泰国等地留学、研修、考察，形成了一支充满生机和活力的教师队伍。本系现有在校专科和高职学生1300多人，学生毕业后大多从事园艺、园林和环保等相关专业的管理和技术工作，学生就业率达98%以上。
园艺与园林系坚持教学、科研和生产相结合，积极倡导“围绕专业办产业，办好产业促专业”的产学研结合新理念，试行企业化管理校内实习基地的新机制，努力使园艺专业优势转化为产业优势，积极开拓国内市场，促进了校内实习基地的建设，促进了专业教学与实习基地的结合，促进了园艺专业的快速发展，通过强化实践教学，使学生不断提高自己的职业岗位能力。
系内拥有先进的实验设备及现代化的园艺设施，供师生实验操作、技能训练、综合实践及教学实习。系有生物工程实验室、植物生长发育实验室、组织培养实训室、植物保护实训室、制图室、美术室、环境监测实验室等。校内实习基地有江苏省太湖常绿果树推广研究中心、园艺中心，校外包括苏州维生种苗公司、常熟海明蔬菜园艺场、嘉汉生态苗木（苏州）有限公司、吴江市苗圃、苏州景原工程设计咨询监理有限公司、苏州市环境监测中心站等。
在多年的教学实践中，始终以培养“懂理论、会操作、能实干”的高等技术应用型人才为目标，加强外语和专业基础理论的教学，为学生打下坚实的基础，使学生就业有门，升学有望；同时增加相关学科、交叉学科的选修课程，努力扩大学生的知识面，使学生成为既具有扎实的基础理论、丰富全面的专业知识，又有实际操作能力、应用能力，具备现代园艺科技人才。本系通过国家劳动部、农业部组织的绿化工、花卉工、化学检验工、蔬菜工、植保工等特有工种职业技能鉴定的学生已近3000人。
信息与机电工程系
苏州农业职业技术学院电子信息技术系是学院的一个年轻的充满生机与活力的系，设有计算机应用技术和计算机网络技术两大专业，计算机应用技术专业包含计算机应用与维护、计算机信息管理两大方向、计算机网络技术专业包含计算机网络技术方向，学生近1000人。本系目前有专兼职教师共38人，其中专任教师26人，双肩挑教师2人，外聘教师10人，副教授16人，中级职称9人；在读研究生8人，平均年龄为37岁，承担着专业课及全院非计算机专业的计算机公共课；承担着劳动和社会保障部全国计算机信息高新技术培训和考试任务；承担、参与并顺利完成了教育部和农业部的《农业生物技术》 、 《生物技术配套光盘》等课件制作任务；参与制作的《百合组织培养》及《人个投资理财》等课件荣获江苏省教育厅“好课件”奖。教师共发表论文20余篇，其中核心期刊论文7篇，有两篇被EI检索收录；主编教材5本；成功申报《Photoshop》、 《C语言程序设计》院级精品课程。
该系为社会培养了各类计算机应用人才500余人，他们既有一定的计算机系统理论 知识，又有较强的实际操作能力；他们既有吃苦耐劳的精神，又有较强的团队协作精神，在各自的岗位上为江苏省的信息化建设发挥自己的聪明才智，受到用人单位的广泛好评。
食品科学系
苏州农业职业技术学院食品系前身是省立苏州农业学校农产制造科，1953年因全省中等农业技术学校专业调整的原因一度停办，1985年复办。作为学校的传统骨干系部，长期以来为全省乃至全国培养了一大批专业技术人员、管理层领导和专家学者，为中国食品行业的发展作出了积极贡献，章克昌、高寿清、张肇范、李培圩等都是他们中的杰出校友。
食品系脱胎于传统的农产制造科，现设有生物制药、食品药品监督管理、食品加工技术、食品营养与检测、生物技术及应用五大专业，包含食品工程、食品生物工程、食品安全与检测、食品检验与质量管理、农产品质量监督与检验、生物制药技术等专业方向；拥有微生物、粮油食品检验、食品理化分析、生物技术、果蔬加工、粮油加工、发酵工艺等专业实验(训)室。专业建设中既保留了原农产制造科的特点，也融合了轻工系统食品加工专业的长处，结合职业技能鉴定，拓宽了毕业生的就业适应面，近几年的毕业生一次就业率都位于同类学校前列。食品系拥有专兼职教师36名，专任教师中具有中高级职称的有19名，先后有9名教师分别赴美国、法国、日本、荷兰、韩国、德国、泰国等国家的大学、研究所进修、研修、技术援助、考察学习；除本校教师之外，本系还拥有一支相对稳定的、来自生产一线的校外兼职教师。专业教师不仅具有良好的理论基础，同时具有良好的专业技能。积极开展应用技术研究，发表专业研究论文，同时加强与企业在技术研究、教学共建方面的合作。在职业教育专业建设方面迈出了可喜的一步。
人文科学系
苏州农业职业技术学院人文科学系于2002年建立，其前身是苏州农业学校的外语学科。人文科学系是苏州农业职业技术学院升格后成立的首批系部之一，培养拥护党的基本路线，掌握商务英语专业必备的基础理论和专门知识，具有从事专业实际工作的综合职业能力和全面素质，适应生产、建设、管理、服务第一线需要的，德、智、体、美等全面发展的高等技术应用型专门人才。适应外向型企业或具有国际业务的企事业单位的专业外贸翻译、外贸公关员、外销员等专业岗位和企事业单位法律顾问，企事业单位文秘等方面的工作。
本系设有商务日语、商务英语、文秘三个专业教研室。已开设商务日语、商务英语、文秘、法律事务四个专业方向。本系现有专兼职专业教师63人，其中包括副教授10人，外教7人。专业教师中，有20多名教师曾被派往日本、加拿大、菲律宾、美国、韩国、法国、意大利等国家进修、考察，形成了一支朝气蓬勃的教师队伍。本系现有在校学生近1300人。
在多年的教学实践中，人文科学系坚持以“质量立系，科研兴系，依法治系，特色强系”为办学理念，深化教学改革。同时，注重政治思想作风建设，用制度加强管理。在学生活动方面也极具人文系特色，教师指导学生组织开展丰富多彩的高品位校园文化活动和社会实践活动，比如英日语技能比赛，女生节，模拟法庭，外语卡拉OK比赛，书法比赛等，以帮助学生树立正确的成才观，培养创新精神，增强实践能力，提高综合素质，千方百计促进毕业生顺利就业。
经济管理学院
成立于2002年，其前身是苏州农业学校基础学科。2007年9月，根据学院事业发展的新需求，组建成立新的基础部，下设化学教研室、中文教研室、数理教研室和公共英语教研室。新基础部现有专职教师23人，其中，中、高级职称12人，院级名师3人，教坛新秀2人。
部门主要承担全院的高等数学、公共英语、中文、物理、化学等公共基础课的教学任务，以占全院5%的师资完成全院12%的工作量。部门教师主编全国统编教材两本，其中一本入选教育部“十一五”规划；主持或主要参与完成省部级课题6项，其中一项成果获省级优秀科研成果二等奖；50余篇科研论文公开发表，核心期刊近40篇，9篇论文被SCI、Ei、CA等权威机构收录，两篇论文获苏州市优秀自然科学论文奖。成绩骄人。
站在苏农新百年的起点上，基础部把“科学谋划，励志耕耘，再上新台阶”作为今后工作努力的方向。瞄准新高度，谋求新发展，争取新突破，用百倍的信心和勇气，力争在教学、科研、改革中取得新成绩，创造新辉煌。
